La segunda temporada de Sidonia no Kishi (Knights of Sidonia) continúa la lucha de la humanidad contra los Gauna, una raza alienígena que destruyó el sistema solar hace mil años. La historia se centra en Nagate Tanikaze, un piloto de Garde (mecha), quien junto a sus compañeros, debe defender la nave espacial Sidonia de los ataques de los Gauna. La temporada explora más a fondo la naturaleza de los Gauna, incluyendo la aparición de quimeras híbridas humano-Gauna, y profundiza en la relación entre Nagate y los demás personajes, especialmente con Tsumugi Shiraui, una quimera que juega un papel crucial en la guerra. En resumen, la segunda temporada de Sidonia no Kishi intensifica la batalla contra los Gauna, introduce nuevas amenazas y dilemas morales, y explora las complejas relaciones entre los personajes en un entorno de supervivencia espacial.